Цифровой Гербарий МГУ (Страница 20 из 20)

03.07.2019.

Облако точек Цифрового гербария МГУ

Источник: https://www.gbif.org/dataset/902c8fe7-8 … 24fed36303

402 606 геопривязок

Статистика привязанных к карте образцов по странам:

Russian Federation 322,297
Ukraine 30,155
Mongolia 8,773
Georgia 5,564
Azerbaijan 4,763
Armenia 3,748
Viet Nam 3,123
Kyrgyzstan 2,836
Latvia 2,176
Ethiopia 1,950
Tajikistan 1,189
Canada 1,188
Kazakhstan 1,151
Turkmenistan 1,078
Paraguay 996
Cyprus 984
Belarus 932
South Africa 911
China 883
United States of America 815
Turkey 763
Iran, Islamic Republic Of 703
Mali 593
Greenland 578
Uzbekistan 525
Afghanistan 480
Israel 433
India 399
Spain 247
Portugal 243
Lithuania 175
Nepal 149
Japan 147
Bulgaria 146
Moldova, Republic of 133
Norway 125
Guinea 118
United Kingdom 111
Syrian Arab Republic 111

04.07.2019.

Цифровой гербарий МГУ: новые массивы этого лета

01 Новый массив: 478 ручных геопривязок (E10)

Автор массива: Владимир Петрович Травкин с iNaturalist. Район E10 охватывает Средний и Южный Урал в пределах Башкирии, Пермского края, Челябинской, Оренбургской и Свердловской областей.

В.П. двигается ретроспективно - от новейших образцов к наиболее старым. Предварительно сборы агрегированы по коллекторам и датам для оптимизации процесса. В этот раз залит в систему период 1956-1968 гг. Текущая карта точек Среднего и Южного Урала дана на скриншоте.

К 478 ручным привязкам добавилось 133 геопривязок по тексту, 11 штук по хэшу (чистый текст), 1802 - по паре "коллектор-дата". Итого почти 2,5 тыс. точек.

Уже 9 498 образцов из 22 495 из района E10 имеют геопривязки. Работа постоянно продолжается.

06.07.2019.

Цифровой гербарий МГУ: новые массивы этого лета

03 Новый массив: 394 координат с этикеток (Московский регион, ГБС)

Автор массива: наш оператор Анастасия Борцова.

Когда к нам поступают в Цифровой гербарий МГУ новые сканы, мы вводим для них ключевые метаданные - название вида, регион, дату сбора, первого коллектора. Такая информация есть почти на всех образцах. Кроме того, иногда на этикетках (особенно на свежих сборах) ясно указаны координаты.

Такие геоданные мы аккуратно вводим в систему сразу, чтобы освободить операторов геопривязки от ненужной двойной работы. Последняя заливка 4300 образцов московского отдела Гербария ГБС РАН (MHA) по гранту РФФИ "Информационная система "Флора Москвы" на платформе Цифрового гербария МГУ" (19-34-70018 мол_а_мос) не стала исключением. Примерно 10% образцов уже содержали координаты, которые и были введены.

Уже 4 931 образцов (из 16 032, или 30,8%), которые представляют московский отдел Гербария ГБС, имеют геопривязки. Работа постоянно продолжается. Первый отчет по проекту № 19-34-70018 мол_а_мос будет подготовлен к 15 октября 2019 г. Фокусная территория проекта - Москва и 10-километровая полоса ближнего Подмосковья. Вы можете принять участие в наблюдениях по флоре Москвы, загружая свои фотографии на портал "Флора Москвы", развернутый на платформе iNaturalist ( https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-moscow ).

07.07.2019.

Есть миллион образцов!

Finally

В Цифровом гербарии МГУ уже 1 002 026 образцов!

Четыре коллекции Гербария МГУ:

Гербарий МГУ (890 256 образцов)
Гербарий мохообразных МГУ (78 059 образцов)
Типовой гербарий МГУ (4 821 образец)
Herbarium Alchemillarum (3 960 образцов)

Московский раздел Гербария ГБС:

Гербарий ГБС РАН (23 902 образца)

Две вспомогательные коллекции:

ДНК растений (1 012 образцов)
Digital Pictures of Living Plants (16 образцов)

09.07.2019.

Цифровой гербарий МГУ: новые массивы этого лета

06 Новый массив: 424 ручные геопривязки Гербария ГБС РАН

Автор массива: наш оператор Иван Кривокорин.

Иван занимался геопривязкой образцов Гербария Главного ботанического сада РАН (MHA), точнее его московского отдела. Эти фонды цифруются по гранту РФФИ "Информационная система "Флора Москвы" на платформе Цифрового гербария МГУ" (19-34-70018 мол_а_мос). Коллеги из ГБС передали в Цифровой гербарий МГУ (https://plant.depo.msu.ru/) 7087 набранных этикеток, которые мы ввели в систему. Обработка данных алгоритмом ИСТРА позволила сгруппировать образцы по местам сбора до начала работы по геопривязке.

Имея табличную выгрузку с текстом этикеток, оператор, не заглядывая в скан, искал указанные места в электронных картографических системах и вводил их координаты.

К 424 ручным привязкам добавилось по алгоритму ИСТРА 117 геопривязок по тексту, 4 по хэшу (чистый текст) и 586 штук по паре "коллектор-дата". Итого 1,1 тыс. точек.

На сегодняшний день 6127 образцов Гербария ГБС (из 23902 залитых) имеют метки на карте. Как только для загруженной на днях четвертой порции Гербария ГБС (около 8 тыс. сканов) мы введем ключевые метаданные, на место встанет еще несколько тысяч пар координат. Сколько - расскажем чуть позже.

12.07.2019.

Цифровой гербарий МГУ: новые массивы этого лета

08 Новый массив: MHA-04 (7890 новых сканов из Московского раздела Гербария ГБС РАН)

Авторы массива: группа операторов сканирования Гербария ГБС РАН под руководством Н.Ю. Степановой.

Оцифровка образцов Гербария Главного ботанического сада РАН (MHA), точнее его московского отдела, идет по гранту РФФИ "Информационная система "Флора Москвы" на платформе Цифрового гербария МГУ" (19-34-70018 мол_а_мос). Четвертая заливка охватывала семейства от Polygonaceae до Brassicaceae.

Работы велись на сканере Microtek ObjectScan 1600 (пр-во Тайвань). Формат изображений - 600 dpi. Уже оцифровано и опубликовано на нашем портале 23 902 образца Гербария ГБС РАН.

Образцы отображены на портале в качестве отдельной коллекции. Реализация совместного проекта позволит оцифровать в Гербарии ГБС РАН около 40 тыс. образцов, что позволит второму по величине гербарию Москвы войти в тройку крупнейших цифровых гербариев России. В свою очередь, Цифровой гербарий МГУ уже стал точкой доступа к 1 миллиону изображений.

Мы открыты для сотрудничества и готовы публиковать цифровые коллекции других гербариев!

== О Гербарии ГБС РАН ==

Гербарные коллекции в ГБС начали накапливаться сразу же после образования сада, документируя флористические и интродукционные исследования, проводимые сотрудниками разных отделов. Однако первые годы он не имел ни помещения, ни какого-либо структурного оформления. Поэтому датой основания гербария ГБС принято считать 1958 г., когда после ввода в строй Лабораторного корпуса, для Гербария был выделен большой зал площадью 280 кв. м. Одновременно была собрана гербарная рабочая группа в составе 5 научных и 2 технических сотрудников отдела природной флоры, которую возглавил В.Н. Ворошилов.

Начало быстрому росту гербария, включавшему тогда б.ч. сборы В.Н. Ворошилова, Б.М. Кулькова и В.А. Штамма из Воронежской и Московской областей, было положено получением почти полного комплекта эксикат Санкт-Петербургского ботанического института (“Гербарий флоры СССР”), дублетов сборов Д.П. Сырейщикова из Московской области.

Дальнейшие поступления были в основном связаны с экспедиционными поездками сотрудников сада за живым материалом для создаваемых экспозиций природной флоры СССР. С самого начала фонды гербария были разделены по географическому принципу на 8 разделов, аналогично коллекционным участкам отдела природной флоры, коллекции которых Гербарий был призван документировать. Это разделы: 1. Российского Дальнего Востока (без Колымы и Чукотки, которые отнесены к Сибири); 2. Сибири (включая Чукотку и Колыму, а также северный и центральный Казахстан, но исключая собственно Урал); 3. Средней Азии (включая южный Казахстан от Тарбагатая до нижней Эмбы); 4. Европейской части бывшего СССР (кроме Крыма, но включая горный Урал); 5. Московской области; 6. Крыма; 7. Кавказа (включая равнинный Дагестан, Ставропольский и Краснодарский края); 8. Дальнего зарубежья (т.е. вне СССР).

Подробности: Скворцов А.К., Белянина Н.Б. Гербарий Главного ботанического сада Российской академии наук. Москва, 2005. 46 с.

14.07.2019.

Цифровой гербарий МГУ: новые массивы этого лета

10 Новый массив: 367 пар коллектор-дата Австралии и Океании

Автор массива: наш оператор Анастасия Дубровская.

Дошла очередь до самого дальнего уголка нашей планеты - Австралии и Океании. В Гербарии МГУ хранится 3406 образцов из этого региона. Что-то собрано сотрудниками МГУ в последнее время, что-то - советскими исследовательскими миссиями. Но основой источник поступления гербария - международный обмен с австралийскими и европейскими гербариями.

Анастасия образец за образцом вводит ключевые метаданные для каждого образца - прежде всего, дату сбора и коллектора. Такая информация есть почти на всех образцах. Кроме того, иногда на этикетках (особенно на свежих сборах) ясно указаны координаты.

Такие геоданные мы аккуратно вводим в систему сразу, чтобы освободить операторов геопривязки от ненужной двойной работы. Примерно 36% образцов уже содержали координаты, которые и были введены. Они происходят, в основном из окрестностей Перта.

Работа продолжается - наши волонтёры приступили к ручной привязке более старых сборов из Австралии. Ждём первых результатов!

18.07.2019.

Коллекции Гербария МГУ: коротко

Гербарий Московского университета (MW) занимает 63-е место в мире по объему фондов. Статистика, приведенная ниже, дана на конец 2018 г. – время, когда мы ежегодно подводим итоги работ в Гербарии.

В общей сложности, Гербарий Московского университета насчитывает 1 047 009 образцов – сосудистых растений и мохообразных. Это точное число известно благодаря оцифровке гербарных фондов, которая была осуществлена в 2015–2018 гг. по проекту "Ноев Ковчег" (грант РНФ № 14-50-00029). Ближайшими "конкурентами" в мировом рейтинге по числу образцов являются гербарии Висконсинского университета, США (WIS), в котором насчитывается 1 078 000 образцов, и Национального политехнического института, Мексика (ENCB), где хранится 1 080 000 образцов. Впрочем, все эти цифры подвижны и довольно быстро устаревают.

Ежегодный прирост фондов в Гербарии Московского университета уже несколько лет держится на отметке около 20 тыс. образцов. В 2016 г. в коллекции было включено 22 013 листов гербария и образцов мхов, в 2017 г. – 19 416, в 2018 г. – 16 340. Такой заметный рост был связан не только с активностью ботаников Московского университета (которые обеспечивают не более половины роста коллекций), сколько с активным поступлением гербарных сборов от сторонних ботаников и организаций. Особенно важно отметить полную передачу в наши фонды небольших, но важных гербариев: лаборатории устойчивости лесных экосистем Костромского университета (2016 г.), Бадхызского заповедника (2017 г.), Института физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН в г. Пущино (2018 г.), Музея природы в г. Владимире (2019 г.). Передача малых гербариев в более крупные – мировая тенденция, и, слава богу, что оставшиеся без попечения коллекции не отправляются на свалку.

Крупнейшим отделом Гербария МГУ является Восточная Европа, которая включает Европейскую Россию (без Крыма и Кавказа), Украину, Белоруссию, Молдавию и страны Прибалтики. Сейчас здесь насчитывается 368 617 образцов. Традиционно самым представительным районом гербария является Московский регион (город и область) – 73 160 образцов, Центральный район – 51 075, Центральный лесостепной район – 47 465, Северный район – 36 993, Нижневолжский район – 22 850. Столь обширные московские коллекции специально исследуются сейчас по гранту РФФИ "Информационная система "Флора Москвы" на платформе Цифрового гербария МГУ" (19-34-70018 мол_а_мос).

Вторым по размерам является отдел Сибири и Дальнего Востока, в который включено 165 476 гербарных образцов. Тенденции последних лет показывают, что ежегодный прирост фондов из Азиатской России почти сравнялся с новыми включениями из Восточной Европы. Больше всего сборов хранится здесь с юга Дальнего Востока – 31 844, Алтая и Саян – 30 575, Чукотки и Камчатки – 25 031, Прибайкалья и Забайкалья – 24 836, Центральной Сибири – 20 047. Обширное включение 2019 г., состоящее из дублетов, поступивших из объединенного Гербария Центрального сибирского ботанического сада РАН (NS+NSK), как ожидается, выведет в лидеры Алтае-Саянский регион.

Третьим по числу образцов Гербария является отдел Кавказа. Здесь насчитывается 100 668 образцов сосудистых растений. Естественно, большинство коллекций представлено с территории России. Традиционный район гербария "Северный Кавказ" из-за этого пришлось поделить на три части для более эффективного доступа к коллекциям. Сейчас больше всего сборов представлено из района К1б (Ставропольский край, Карачаево-Черкесия, Кабардино-Балкария) – 18 930 листов, K6 (Азербайджан) – 14 876, К1а (Краснодарский край и Адыгея) – 14 682, К5 (Армения) – 10 668, К4 (Грузия) – 9 016. Большие и, при том, стремительно растущие коллекции Западного Кавказа специально изучаются сейчас по гранту РФФИ "Самая богатая региональная флора России: информатика биоразнообразия сосудистых растений Краснодарского края" (19-44-233012 р_мол_а).

Очень важным и интересным отделом Гербария МГУ является отдел Средней Азии, в котором хранится 97 141 образец. Сейчас больше всего сборов хранится у нас из Западного Тянь-Шаня (и Каратау) – 22 420 образцов, Памира и Памиро-Алай – 17 069, Северного и Центрального Тянь-Шаня – 12 980. Границы районов в этом отделе не совпадают с государственными границами. По странам Средней Азии объемы наших фондов таковы: Казахстан – 50 309 образцов, Киргизия – 17 503, Узбекистан – 10 622, Туркменистан – 10 317, Таджикистан – 9 551. Продолжается ежегодное пополнение фондов этого отдела за счет передачи многочисленных материалов группы М.Г. Пименова из Ботанического сада МГУ. Не будет исключением и 2019 г.

Отдел Западной Европы насчитывает на сегодняшний день 40 481 образец. Этот отдел не районирован. В основном, он сформировался за счет обмена между отдельными коллекционерами 19 века и крупными учреждениями в 20 веке. Впрочем, оригинальные коллекции сотрудников Московского университета могут составить при окончательном учете 20% отдела.

Отдельно в Гербарии МГУ хранится гербарий Крыма, который находится в идеальном состоянии, благодаря усилиям Н.К. Шведчиковой. Сейчас здесь насчитывается 32 748 образец, в т.ч. около 2 100 образцов, включенных в коллекцию за последние шесть лет.

Отдел Монголии со времени полевых работ И.А. Губанова находится, де-факто, в законсервированном состоянии и лишь случайно пополняется за счет дублетов. Сейчас здесь хранится 27 341 образец.

Напротив, отдел Зарубежной Азии (без Средней Азии и Монголии), который насчитывает 24 681 образец, продолжает стремительно расти, прежде всего, за счет исследовательских миссий во Вьетнаме. Здесь рост фондов за шесть лет составил 4 100 образцов.

Небольшая коллекция растений Америки (как Северной, так и Южной) хранится в учебной аудитории 502. Здесь имеется 12 236 образец, полученных, преимущественно, по линии международного обмена.

В последнее время значительно пополнился гербарий Африки за счет разбора многочисленных коллекций В.Н. Павлова и Д.А. Петелина из Эфиопии. Сейчас африканский отдел состоит из 9 057 образцов, что на 2 300 больше, чем в конце 2012 г.

Гербарий мохообразных состоит из мхов (77 410 образцов) и печеночников (3 959 образцов). Самыми представительными являются при этом сборы из Средней Сибири (Красноярский край, Тыва и Хакасия) – 8 457 образцов, Северного Кавказа и Предкавказья – 7 691, Центрального Нечерноземья (без Москвы и Подмосковья) – 7 580, юга Дальнего Востока – 7 279, Западной Европы – 7 025.