Всех удалять не будем - только тех, которых нет в базе данных.
К какому роду относится гибрид почти всегда можно понять по снимкам родительских видов.
А теперь о более общих аспектах проблемы.
Снимки, привязанные к родам и прочим надвидовым таксонам - это плохо структурированная информация, работа с которой очень малоэффективна. Если мы будем коллекционировать фото искусственных гибридов (коих огромное множество), доля слабо упорядоченной информации на сайте будет неизбежно расти, что самым отрицательным образом скажется на информативности проекта. И этого, по моему твёрдому убеждению, следует всячески избегать.
Что же касается предлагаемого ограничения количества снимков искусственных гибридов - это трудно формализуемое (а значит - трудно реализуемое) правило, выполнение которого сильно зависит от человеческого фактора. Лично мне не хочется посвящать значительную часть времени отслеживанию количества снимков гибридов, лежащих большой кучей в наборе фото какого-либо рода. Уже сейчас там бывает довольно много фотографий видов, отсутствующих в базе, так не будем же усугублять проблему.
Ещё раз повторюсь - нельзя объять необъятное! Эффективность любого инструмента (и, в частности, информационно-поисковой системы, коей является наш сайт) во многом связана со степенью его специализации. Специализированные инструменты обычно работают лучше, чем универсальные. А потому, если мы хотим, чтобы "Плантариум" успешно выполнял свои основные задачи, нужно вовремя остановиться.
Упорядочивание и представление коллекций гибридных форм требует иной организации данных. Если кто-то в этом сильно заинтересован, он реализует соответствующий проект. Но это будет не в рамках "Плантариума". Мы предоставим информацию о родительских видах. Кто-то - о гибридных формах. Я с удовольствием добавлю ссылку на страницу с описанием культурных гибридных форм. Возможно, со страниц сайта о культиварах сделают ссылки на страницы "Плантариума", содержащих описания родительских видов. И это будет правильно.