По моему субъективному мнению, в Euro+Med процент ошибок поменьше, хотя там тоже встречаются огрехи. Проблема с The Plant List в том, что информация там собрана из разных источников, с различной степенью достоверности. Почему-то особенно много проблем со сложноцветными. Кроме того, есть проблeмы с омонимами, со множеством комбинаций, которые на самом деле не были действительно обнародованы ну и т.д.
IPNI сравнивать с остальными базами данных вообще не очень корректно - они просто предоставляют информацию о обнародованных названиях растений, но не приводят информации о синонимах. Понятно, что кое-что в IPNI пропущено (обычно из-за отсутствия копий оригинальных публикаций), но, теоретически, им можно написать и сообщить об этом.