Re: Цифровой Гербарий МГУ

05.09.
Облако точек Цифрового гербария МГУ в разных проекциях

Основано на 260 725 образцах (на 1 сентября 2018 г.)

Источник: https://www.gbif.org/dataset/902c8fe7-8 … 24fed36303

https://pp.userapi.com/c849232/v849232609/6b484/dZ5yG6TW8Sk.jpg


https://pp.userapi.com/c849132/v849132609/65950/5MqYL9Rw3xk.jpg


https://pp.userapi.com/c845321/v845321609/dfce3/iXivaBoYSIY.jpg

Re: Цифровой Гербарий МГУ

09.09.

GBIF-копия Цифрового гербария МГУ за 10 месяцев набрала 17 цитирований!

Постоянно мы загружаем в Цифровой гербарий МГУ новые массивы текстовых данных и геопривязок. Раз в году он пополняется также новыми сканами.

Еженедельно (обычно утром в пятницу) система автоматически обновляет наши данные, залитые в GBIF. Отсюда, в свою очередь, они отправляются в различные загрузки пространственных и биологических данных для всевозможных научных исследований в области биогеографии, экологии, палеоботаники и биоклиматического моделирования. Результаты таких исследований публикуются в топ-журналах, - как, например, вышедшая в Nature статья "The future of hyperdiverse tropical ecosystems"  ( https://www.nature.com/articles/s41586-018-0301-1 ).

На 2 сентября 2018 г. на наш GBIF-датасет ( https://www.gbif.org/dataset/902c8fe7-8 … 24fed36303 ) накопилось уже 17 цитирований: наверно, это даже больше, чем число ссылок на образцы из физической коллекции Гербария Московского университета.

О том, как устроена GBIF-модель выгрузки данных и подсчета цитирований можно прочитать здесь: https://vk.com/wall-134484155_935

https://pp.userapi.com/c850132/v850132324/16070/JxEkcfMXwXQ.jpg

Re: Цифровой Гербарий МГУ

11.09.
Презентация утреннего приглашенного доклада А.П. Серегина на Международной конференции «Информационные технологии в исследовании биоразнообразия», 11–14 сентября 2018 г. в Иркутске.

https://pp.userapi.com/c849020/v849020846/75cc0/GNDq-aBL634.jpg

https://www.researchgate.net/publication/327545192_Moscow_Digital_Herbarium_OCR-mining_of_the_text_data_for_the_Russia's_largest_biodiversity_database

Re: Цифровой Гербарий МГУ

16.09.

Верхнее Поволжье: 10 тыс. новых точек

Благодаря нашему сотрудничеству с командой gbif.ru на портал Цифрового гербария МГУ ( https://plant.depo.msu.ru/ ) и его GBIF-зеркала ( https://www.gbif.org/dataset/902c8fe7-8 … 24fed36303 ) залит большой массив новых пространственных данных по Верхней Волге. Около 10 тыс. образцов из Ярославской, Ивановской и Костромской областей, а также с севера Нижегородской области теперь надежно привязаны к карте. На скриншотах эти изменения особенно наглядны (если быстро щёлкать, то получится анимация).

Хорошо видно, что в Гербарии Московского университета образцы из этих регионов представлены неравномерно. Особенно заметны "дыры" на большей части правобережных районов Ярославской области, в Ярославском Заволжье, на западе и особенно востоке Ивановской области. Лучше представлена Костромская область, хотя и здесь из многих местностей сборы почти отсутствуют.

Для сравнения обратим внимание на сопредельные районы, которые специально изучались многие годы: Владимирскую область (внизу карты), Удомельский район Тверской области (плотное облако точек на западе), а также ближайшие окрестности Москвы.

Автор верхневолжского датасета - Наталья Иванова.

https://pp.userapi.com/c849428/v849428271/76cab/Amgwvl4mokc.jpg


https://pp.userapi.com/c851036/v851036930/574f/7B5HXboK_XE.jpg

Re: Цифровой Гербарий МГУ

20.09.

СПАСИБО!!!

В Цифровом гербарии МГУ ( https://plant.depo.msu.ru ) почти 1 млн образцов. С самого начала работы портала в паспорте каждого образца мы разместили красную ссылку "Сообщить об ошибке". За год (с 18.09.2017 по 18.09.2018) наши пользователи воспользовались этой кнопкой 364 раза!

Сообщения об ошибках в определении, ошибках в географической индексации, опечатках в русских названиях и многие другие ляпы и неточности были выявлены нашими внимательными юзерами. В результате наш массив данных стал немного чище и чуть-чуть надежнее как источник данных.

Технологически нам оказалось удобным не отвечать на каждое письмо пользователей, а вносить все изменения скопом 2-3 раза в год. Сейчас, накануне четвертого этапа сканирования Гербария Московского университета, мы внесли в базу почти все накопившиеся изменения, а те, что не внесли - аккуратно учли и внесем их вместе с ресканами в начале декабря.

Хочу выразить огромное спасибо всем неравнодушным ботаникам и натуралистам, сообщавшим об ошибках. Ни одно замечание не прошло мимо нас. Пожалуйста, пользуйтесь кнопкой "Сообщить об ошибке" чаще!

https://pp.userapi.com/c846016/v846016801/ed080/i5crsdlxbwM.jpg

Re: Цифровой Гербарий МГУ

23.09.

А Гугл... Он всё равно нас съест!

В момент, когда мы выставили под индексацию поисковыми системами open-версию Цифрового гербария МГУ ( https://plant.depo.msu.ru/open/ ) Google съел миллион наших картинок и выставил их в результаты поиска.

Но пользователям интернета миллион новых картинок сразу не нужен. Алгоритмы Google учитывают востребованность запросов, и изображения, которые никто не запросил, из поиска постепенно убираются.

Так уже через 3 недели число картинок в индексации сократилось с 1 млн до 500 штук. Однако постепенный рост популярности нашего ресурса, использование картинок в виде ссылок и скачиваний файлов, а также востребованность самой темы привели к тому, что каждую неделю до 1 тыс. новых картинок возвращаются в индексацию Google.

Перед вами небольшая часть изображений, вернувшихся в Google-поиск за последние 7 дней.

https://pp.userapi.com/c849328/v849328372/7e9f1/ranTYlx6Q00.jpg